| GRUPO A |
| Primera
vuelta |
| Primera jornada (30-05-99) |
| Elche-Universidad de Las Palmas |
| Melilla-Burgos |
| Segunda jornada (06-06-99) |
| Universidad de Las Palmas-Melilla |
| Burgos-Elche |
| Tercera jornada (13-06-99) |
| Elche-Burgos |
| Melilla-Universidad de Las Palmas |
| Segunda
vuelta |
| Cuarta jornada (20-06-99) |
| Universidad de Las Palmas-Elche |
| Burgos-Melilla |
| Quinta jornada (27-06-99) |
| Elche-Melilla |
| Universidad de Las Palmas-Burgos |
| Sexta jornada (30-06-99) |
| Melilla-Elche |
| Burgos-Universidad de Las Palmas |
| GRUPO B |
| Primera
vuelta |
| Primera jornada (30-05-99) |
| Getafe-Sevilla |
| Murcia-Barakaldo |
| Segunda jornada (06-06-99) |
| Sevilla-Murcia |
| Barakaldo-Getafe |
| Tercera jornada (13-06-99) |
| Getafe-Barakaldo |
| Murcia-Sevilla |
| Segunda
vuelta |
| Cuarta jornada (20-06-99) |
| Sevilla-Getafe |
| Barakaldo-Murcia |
| Quinta jornada (27-06-99) |
| Getafe-Murcia |
| Sevilla-Barakaldo |
| Sexta jornada (30-06-99) |
| Murcia-Getafe |
| Barakaldo-Sevilla |
| GRUPO C |
| Primera
vuelta |
| Primera jornada (30-05-99) |
| Polideportivo Almería-Real Madrid B |
| Bermeo-Levante |
| Segunda jornada (06-06-99) |
| Real Madrid B-Bermeo |
| Levante-Polideportivo Almería |
| Tercera jornada (13-06-99) |
| Polideportivo Almería-Levante |
| Bermeo-Real Madrid B |
| Segunda
vuelta |
| Cuarta jornada (20-06-99) |
| Real Madrid-Polideportivo Almería |
| Levante-Bermeo |
| Quinta jornada (27-06-99) |
| Polideportivo Almería-Bermeo |
| Real Madrid B-Levante |
| Sexta jornada (30-06-99) |
| Bermeo-Polideportivo Almería |
| Levante-Real Madrid B |
| GRUPO D |
| Primera
vuelta |
| Primera jornada (30-05-99) |
| Cultural-Córdoba |
| Ferrol-Cartagonova |
| Segunda jornada (06-06-99) |
| Córdoba-Ferrol |
| Cartagonova-Cultural |
| Tercera jornada (13-06-99) |
| Cultural-Cartagonova |
| Ferrol-Córdoba |
| Segunda
vuelta |
Cuarta jornada (20-06-99) |
| Córdoba-Cultural |
| Cartagonova-Ferrol |
| Quinta jornada (27-06-99) |
| Cultural-Ferrol |
| Córdoba-Cartagonova |
| Sexta jornada (30-06-99) |
| Ferrol-Cultural |
| Cartagonova-Córdoba |